〜pKa・等電点・緩衝域を一気につなぐ〜

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こんにちは!
生化学の勉強を頑張っている皆さん、
今日も本当にお疲れさまです。

1. この記事が解決してくれること

滴定曲線、まだ形だけ🧠暗記していませんか。

pKa、等電点、緩衝域
✏️試験でつながらなくなる。

この記事では、グリシン を使って、
滴定曲線を1本の流れとして読めるようにします💯

 

2.H⁺ がつく場所と外れる場所。 まず基本をおさえよう

まず前提として、
アミノ酸には、H⁺ を受け取れる場所 と、
H⁺ を手放せる場所 があるよ。

受け取れる場所と、手放せる場所があるの?

そう。
マイナスの場所は、
プラスを受け取れる

・H+を持っているからプラスの状態である場合、
H+を手放すことができるんだ。

どこが受け取れる場所なのか?
どこが手放す場所なのか?
常に意識しておくと、今何がおこっているのか
わかりやすくなるよ。

 

ではその場所はどこなのか?
詳しくみていこう。

前回のブログ記事、
アミノ酸のイオン性
おさらいになるけれど、

アミノ酸は中性付近の水溶液の中では
NH3+COO-の状態で存在するよ。

あ、思い出した。
水の中では、その形が多いんだよね。


そう。
酸性、つまり pH が低いと、H⁺ が多い。
だからアミノ酸は、H⁺ を受け取った形
なりやすいんだ。

H⁺ がたくさんあると、
受け取るほうに傾くのか。


逆に、pH が上がると、H⁺少なくなる。

だからアミノ酸は、
少しずつ H⁺ を手放していくよ。

なるほど。
今度は持っている H⁺ を手放していくんだね。


COO-はH+を受け取れる場所。
NH3+はH+を手放せる場所。

それぞれの”場所”の意味を
ここでしっかり確認しよう!

電気的なバランスはこんな感じ。

・H+がたくさんあると、
H+を受け取るからプラスに傾く。

H+が少ししかないと、
持っているH+を手放すからマイナスに傾く。

周囲のH+に応じて、プラス寄りになるか、
マイナス寄りになるかが変わるんだ。


要するに、COOーNH3+はこんな風に変化するんだ。


アミノ酸滴定曲線は、
この H⁺ の出入り を線で見せている図なんだ。

今回は、横軸を pH縦軸を OH⁻ の滴下量
しているよ。

酸性の溶液からスタートして、
それにOH⁻を少しずつ加えると、H+が中和されるから
溶液は酸性からだんだん中性→アルカリ性に変わっていく。

そのとき、アミノ酸のイオン性がどう変化するのかを
見ているよ。

ただし、教科書や問題集では、
横軸が OH⁻ の滴下量縦軸が pH のグラフも
よく出てくるよ。試験では、軸の意味を取り違えないように
気をつけてね。

同じ滴定曲線でも、軸が逆のことがあるんだ。
そこはちゃんと見ないと危ないね。

 

3. いちばんシンプルな グリシンで意味をつかむ

グリシンは、基本のアミノ酸の形に、
側鎖は ”Hだけ” だったよね。

その通り。
グリシンは、側鎖がいちばんシンプルなんだ。
アミノ酸の基本を考えるときの出発点にしやすいんだよ。

 

グリシンの滴定曲線を読む上で
注目すべき主な場所は2つ。
COO-
NH3⁺

まずはその2か所を見ればいいんだね。

うん。ではまず、pH がとても低いときを考えよう。
pH がとても低いというのは、
まわりに H⁺ がたくさんある、ということなんだ。

H+が周りにたくさんあると、
グリシンは H⁺ を取り込みやすいんだね。
その通り。低い pH では、
グリシンは H⁺ をしっかり持った形になりやすい。
つまり、H⁺受け取れる側も、
H⁺手放せる側も、
どちらも H⁺ を持った形になりやすいんだ。

ということは、
COOHNH3⁺ の形ということ?

そう。つまり最初は、
完全にプロトン化された状態なんだ。
言いかえると、
受け取れるだけの最多の H⁺ を受け取った状態だよ。

滴定曲線の左端は、
H⁺ をたくさん持ったスタート地点 と考えるといいよ。

なるほど。
左端は、プロトンが多い。
だから最もプロトン化された状態で出発する
んだね。

4.最初に変わるのは COOH。一気に理解が進む

ここから pH を上げていくと、
まず最初に変化しやすいのは
COOH なんだ。

最初は COOH から変わるんだね。

そう。
前のブログ記事
アミノ酸のイオン性でも話したけれど、
COOHH⁺ は、
もともと COO⁻ から離れやすいんだ。

だから、H⁺がたくさんあるときは我慢しているけど
まわりの H⁺ がだんだん少なくなると、
待ってました!とばかり
H⁺ がCOOH から外れようとするんだ。

へえ。
酸性から塩基性へ向かうとき、
もともと外れやすい
COOH からH+が外れるんだね。

その通り。そしてこのとき、
NH3⁺ はまだ H⁺ を持ったままなんだ。

NH3⁺ は、H⁺ をつけたままのほうが
絶対に安定、という意味ではないよ
でも、その pH では
H⁺ をつけたままでいるほうが有利というか、
楽なんだ。
そこも、前のブログ記事
アミノ酸のイオン性で詳しく話しているよ。
だから、酸性から中性へ向かう途中では、
COO⁻NH3⁺ を両方持つ形になるんだ。

そう。これが
両性イオン(双生イオン・zwitterion) だよ。

プラスもある。
マイナスもある。
でも全体としては net charge 0

言い換えると、
分子全体としては正味電荷は 0

等電点では、
この両性イオンがいちばん多くなるんだ。

へえ。
プラスもマイナスもあるのに、
全体では 0 なんだ。

5.【最重要】pKa と緩衝域が ここでつながる

ここで、滴定曲線の見方が少し見えてくるよ。

最初の段差は、
COOH から H⁺ が外れていく変化 を
表しているんだ。

そしてその変化の真ん中あたり、
つまり 半分くらい外れたところ
pKa なんだよ。

なるほど。
pKa って、どの pH で
その H⁺ が半分くらい外れるかを表す数値なんだね。

 

そう。pKa とは
H⁺ の外れやすさを表す値
だよ。

たとえば、pKa が小さいということは、
低いpHH+を離すということ。

つまり「H⁺ を持ち続ける」より「H⁺ を放す」ほうに
傾きやすい、ということなんだ。

 

ブレンステッドの定義では
= H⁺ を与えるものだったよね。
言い換えれば、H⁺ を手放すものと言える。

pKa が小さいとは、
より低いpHでH+を離すということ。
つまり、としてふるまいやすい傾向があるとも言えるね。

その結果、マイナス電荷をもつ形が増えやすい。

ただし大事なのは、
必ずしも物質全体がマイナスになるとは限らない
ということなんだ。

 

緩衝作用とは?

pKaの付近では
H⁺ を持つ形と、離した形が
半分ずつくらい共存している。

だから buffer として働きやすい、
つまり緩衝作用が大きいんだよ。

緩衝作用が大きいって、どういう意味なの?

酸やアルカリが少し入ってきても、
pHが急に変わりにくい
という意味だよ。

pHが急に変わりにくい?

たとえば、ふつうの水は、
少し酸やアルカリが入ると pH が変わりやすい。

でも 緩衝作用があると、が少し入っても、
すぐには強く酸性にならない。アルカリが少し入っても、
すぐには強くアルカリ性にならない。

つまり、緩衝作用
「pHのゆれを小さくするクッション」
のようなものなんだよ。

ああ。
急に変わりすぎないようにしてくれるんだ。

そう。アミノ酸でいうと、
H⁺受け取れる形H⁺放せる形 の両方が
ほぼ同じ量でいるとき、
緩衝作用が大きいんだ。

あっ!だから pKa の近くなんだね。

そう。
pKa の近くでは
H⁺ を受け取る
H⁺ を放す
その両方に対応しやすく
pHを変わりにくくできるんだよ。

 


そして、pKa のおよそ ±1 pH のところを、
緩衝域 と呼ぶよ。

なるほど。
pKa の近くで、緩衝作用が大きいところ が、
緩衝域 なんだね。

6.次に動くのは NH3⁺。 2つ目の段差

さらに pH を上げていくと、
今度は NH3⁺H⁺ を離すよ。

へえ。
今度は NH3⁺ のほうが変わるんだね。

そう。この時点では、
すでに COO⁻ になっているので、
NH3⁺H⁺を手放すと
全体としてはマイナスが強くなる。

つまり、pH が高い側では、
OH⁻ を加えるにつれて、グリシンはしだいに
に帯電していくんだ。

 


ここで2つ目の段差ができる。

そして、その真ん中あたりに、
もう1つの pKa があるよ。

へえ。
NH3⁺ の pKa は約 9.6 なんだね。
COO-と比べてpKaが高いね。
かなり塩基性に傾かないと、
H⁺ が外れないということだね。

7.なぜ S字なのか。 段階ごとの脱プロトン化で見る

では、なぜ滴定曲線は
あの独特な S字 になると思う?

ゆるやかに変化する理由?

そう。その理由はシンプルだよ。

それは、H⁺ が一気に
全部外れるわけではないからなんだ。

最初に外れやすい場所がある。

に外れる場所がある。

その途中には、
半分ずつ混ざる領域がある。

この変化が、
なだらかな部分
立ち上がる部分 を作るんだよ。

だから滴定曲線は、
段階ごとの脱プロトン化の記録
と言えるね。

一気に全部じゃなくて、
順番に外れていくからなんだね。

8. 等電点は“なんとなく真ん中”ではない

ここで、よく混乱する 等電点 を整理しよう。

等電点、つまり pI
分子全体のnet chargeがゼロ、言い換えると
正味電荷が 0 になる pH のことなんだ。

グリシンでは、
それは 両性イオン(双性イオン・zwitterion)
いちばん多いあたりになるよ。
グリシンで両性イオンが多いあたりが等電点になるのは、
その形が、
分子全体としてちょうど正味電荷 0 だからなんだ。
じゃあ実際に等電点って
計算でも求められるの?

グリシンのように、
正味電荷 0 の形をはさむ pKa が 2つある場合は

pI = (pKa1 + pKa2) / 2 で求めるよ。

グリシンなら、
pI = (2.34 + 9.60) / 2 = 5.97 だね。

大事なのは、
全部の pKa を足すのではなく、
正味電荷 0 の形をはさむ 2つの pKa を使う

ことだよ。

つまり、最初の pKa と
2つ目の pKa の
ちょうど間くらいに、
pI が来るってこと?


そのとおり。

ここで大事なのは、
等電点は「なんとなく真ん中」ではなく、
電荷が打ち消し合う形が中心になる場所
ということなんだよ。

見た目の真ん中じゃなくて、
電荷が 0 になることが大事なんだね。

 

9. 試験ではこの3つ。 “どこがいつ変わるか”を見る

では、試験ではどこを見るのか。
まず見るべきはこの3つだよ。

1つ目:どこで H⁺ が外れているか。
2つ目:それぞれの pKa がどの変化に対応しているか。
3つ目:どの pH で正味電荷が 0 になるか。

つまり、
滴定曲線は「形」を覚えるのではなく
どの部位がいつ脱プロトン化するか
を追うことが、得点につながるんだ。

たしかに。
今日一緒に勉強したことで
その考え方が身についたよ。

10. ここだけ押さえれば大丈夫。 グリシン 滴定曲線の最短ルート

ここまでを、超圧縮するとこうなるよ。
・低い pH では、H⁺ をたくさん持っている。
・最初に COOH から H⁺ が外れる。
・中間で 両性イオン(双性イオン)zwitterion になる。
・次に NH3⁺ から H⁺ が外れる。
・pKa は半分ずつの点。
・pI は net charge 0 の点。

おお。
こう並ぶと、流れがすごく見やすいね。

11. 🍀ブログ特典 豆知識

等電点で、なぜタンパク質は集まりやすくなるの?

こはく。
アミノ酸と同じように
タンパク質にも等電点があるんだよ。

タンパク質にも等電点があるの?

そう。
タンパク質の等電点
= たくさんのアミノ酸が集まった
全体の電荷が 0 になる pH

そして等電点の付近では
タンパク質が集まって沈殿しやすい。

えっ?
等電点だと、どうして
タンパク質は集まりやすくなるの?

わかりやすく説明するね。

アミノ酸やタンパク質には、
プラスマイナスの電荷があるよね。

この電荷があるおかげで、
分子どうしは反発し合い
水の中でも散らばって存在しやすいんだ。

電荷があると、例えば磁石のプラスプラス
反発し合う様に
分子同士が近づきすぎにくくなるんだね。

そう。
ところが、等電点では話が少し変わるよ。

等電点とは、
分子全体の正味電荷が 0 になる pH のことだったね。

このとき、分子全体としては
プラスでもマイナスでもなくなるため、
分子どうしの電気的な反発が小さくなるんだよ。

反発が弱くなると、どうなるの?

反発が弱くなると、
分子どうしが近づきやすくなるんだ。

その結果、
・水に溶けにくくなる。
・分子どうしが集まりやすくなる。
・沈殿しやすくなる。
ことがあるよ。

つまり、等電点では「ばらばらでいにくくなる」んだ。

なるほど。
だから、集まって沈みやすくなることがあるんだね。

その通り。
これは、タンパク質を取り出したり、
分けたりするときの大事な考え方なんだ。

実験では、pH を等電点に近づけて
タンパク質を沈殿させる ことがあるよ。

ABOUT ME
Dr. しろねこ
ねこが好き。医師・医学博士。 留学先で学生さんに生化学を教えたことがきっかけで、 「むずかしい」を「おもしろい」に変える入口を届けたいと思うようになりました。 日々のパフォーマンスを上げるために、筋トレもコツコツ続けています。